这是猫打喷嚏的最常见原因之一，最常见的病原体是病毒（疱疹病毒，杯状病毒）。另外，细菌感染包括支气管炎博德特氏菌，犬链球菌，支原体和衣原体等也被认为是引发猫上呼吸道感染的主要原因，但这类情况相对较少。然而，任何类型的鼻炎病例，都可能会被细菌继发感染并增殖。这里要提醒的是，用棉签擦拭鼻子进行细菌的培养没什么帮助，因为结果通常只会反映细菌的继发定殖。

对于病毒感染的病例，想要分离病原体是有挑战性的，最近大部分临床诊断已经开始采用PCR（聚合酶链式反应）测试方法了。隐球菌感染也可能导致猫打喷嚏；这通常可以通过细胞学检查进行辨别，血清学检查也可用于感染的确诊和鉴别诊断。